en que sentido mejor?
en calidad es muchisimo mejor ya que es un formato sin perdida y mp3 es un formato con peridida, por si no sabes que significa eso, significa que a partir del flac se puede recuperar la onda de audio original en cambio a partir de un mp3 no ya que en su compresion partes de esta son recortadas y esa info se pierde.
En compresion es superior mp3 porque por mas que pierda info su rango de compresion es muchisimo mayor que el de flac, un mp3 puede reducir un 90% el tamaño de un archivo de audio digital, en cambio flac con suerte llegue a un 50%.
Mp3 tambien esta mucho mas difundido ya es standard y hay miles de aparatos aparte de una pc capaces de reproducirlo cosa que no pasa con Flac y otros formatos con y sin perdida.