[AYUDA] Empaquetamiento del ADN

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Muchachos, Si un cromosoma metafásico con una longitud de 4.0 micrometros contiene una única molécula ...

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alex8615 escribió el 20/11/2007 a las 21:26 hs.

¿Mensaje inapropiado?

#1 [AYUDA] Empaquetamiento del ADN

Muchachos,
Si un cromosoma metafásico con una longitud de 4.0 micrometros contiene una única molécula de ADN de 120 *10^6 pares de bases. ¿ Cómo es la relación de empaquetamiento del ADN?

Como la doble hélice del ADN da una vuelta completa cada 10 residuos (3.4 nanometros), entonces se tiene:

10 bases equivalen a 3.4 nm
120 * 10^6 bases equivalen a "X"

Entonces "X" es igual a 4.1 *10^7 nm, lo cual equivale a 40800 micrometros.

Por tanto la relación del empaquetamiento del ADN sería de 40800 : 4 .

Pero aquella relación no me convence ya que aquel dato (408009 ) es muy grande comparado con el tamaño de aquel cromosoma ( 4 micrómetros).

Por favor ayudenmen

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Usuario inexistente escribió el 20/11/2007 a las 23:04 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#2 Re: Empaquetamiento del ADN

Voy a prender la MatiBQ señal, y la Kremar señal a ver si te pueden auxiliar...

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MatiBq escribió el 21/11/2007 a las 11:41 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#3 Re: Empaquetamiento del ADN

Pasa q no estas teniendo en cuenta el "grosor" de la hebra de DNA (q es aproximadamente 2nm). Si vos agarras un hilito muy muy finitito y lo enrollas como el cable de los telefonos viejos, podrias reducir su largo a 1/3, obtiendo un hilo mas grueso, pero tambien mucho mas corto. Si a esto lo tomas como un hilo nuevo, y lo volves a enrollar sobre si mismo como un telefono, lo volves a reducir a 1/3 (osea q del original vas a 1/3*1/3= 1/9), con una 3ra ves llegarias a 1/27, y asi...

Vos pones q la relacion seria 1:10200, si vos hicieras 8 empaquetamientos susecivos, llegarias a 3^8 = 6561, es decir una reduccion de la longitud de 1/6561, si tomamos los 40800 micrometros y lo dividimos por 6561 ~ 6,22 micrometros. Ya no esta tan lejos de los 4, no?

Entonces enrollar inteligentemente un hilo, efectivamente acorta el largo, a costa de q gane mas y mas grosor, pero como partis de un numero ridiculamente chico, el grosor final va a seguir siendo mas pequeño q el largo.

Si podes aceptar mas o menos la idea q te expongo, entonces te va a resultar mas facil entender como es q se puede pasar de 40800 micrometros a solo 4. Harian falta 8 empaquetamientos sucevios de 1/3... bueno por suerte la evolucion supo ser mas inteligente q eso, y lo soluciono con solo 4 pasos, pero q compactan mucho mas q 1/3 (aunq no todos lo mismo), mira este esquema:

->En la primera tenes 3 vueltas de DNA por cada porteina, estarias en el orden de 1/3.

->En la segunda, por cada giro se ponen ~9 de esas proteinas por giro (en la jerga las podes encontrar como "perlas"), y a su ves estan mas compactadas entre si.. tomemos un 1/10

->La 3ra es la mas efectiva de todas, en este esquema no se ve del todo bien (al final te pongo otro, pero con link, por q deformaria el post), pero deberia estar en el orden de 1/20, a costa de ganar mucho grosor.

->Y una cuarta, q lo enrolla tal cual cable de telefono, pero muy apretado. Mas o menos en el orden de 1/10, disculpa el esquema feo :

Fijate q el largo de una de esas cadenas, deberia ocupar aproximadamente el de 5 "rulos", de ida y de vuelta, osea q estariamos hablando de un compactamiento de ~1/10.

Finalmente podemos estimar algo mas o menos asi: 1/3*1/10*1/20*1/10 = 1/6000

40800 / 6000 = 6,8 micrometros. No le anda tan lejos no?

Igual esto esta explicado muy a ojo, y con datos estimativos, por favor que a nadie se le ocurra afirmar como verdad absoluta los valores de compactamiento 1/3, 1/10, 1/20 y 1/10. Deberian andar cerca de esos valores, pero no tengo los datos firmes. Lo hago con fines "didacticos" si se quiere, deberia ser tomado de esa forma, como numeros para poder entender, y nada mas.

Aca te dejo otro esquema q me gusta mucho mas, pero esta en lo "ancho" y deformaria todo el foro si lo pongo como imagen:

Empaquetamiento del DNA

Espero resulte util.. como siempre, cualquier duda q tengan, chiflen. Q en la medida de lo q pueda voy a tratar responder.

salu2

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Originalmente publicado por Hibbert

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Usuario inexistente escribió el 21/11/2007 a las 20:30 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#4 Re: Empaquetamiento del ADN

Pd:
Cita:
Originalmente publicado por Hibbert
Voy a prender la MatiBQ señal, y la Kremar señal a ver si te pueden auxiliar...

HUENIIIIIIIISIMO

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supercuerda escribió el 30/11/2007 a las 23:42 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#5 Re: Empaquetamiento del ADN

El motor molecular que se encarga del "empaquetamiento" , posee un programa...? ya se hallo como esta codificado el mismo..? Tengo entendido que por ejemplo la "miosina" (que contrae las fibras musculares) alcanza los 5 picoNewtons y la RNA polimerasa es capaz de ejercer hasta 20 picoNewtons, como es esto posible..?

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MatiBq escribió el 01/12/2007 a las 03:02 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#6 Re: Empaquetamiento del ADN

No entiendo tu pregunta, q es lo q intentas decir con "alcanza".

Si te puedo contar q el motor molecular del empaquetamiento posee un "programa" y se conoce bastante de como trabaja.. y es mas q interesante, ya q no es un estado de todo o nada (compactado - laxo), si bien al momento de la division celular se encuentra en estado de maxima compactacion. Durante su vida "normal" las moleculas de DNA tienen ciertos sectores compactados y otros no, siendo estos ultimos los q pueden expresar su informacion genetica, es una de la formas en q la celula regula sus funciones. Y no es igual en todas las celulas.. una celula del higado, tiene en forma laxa las regiones del DNA q codifican para las proteinas del higado, mientras q las celulas del pancreas tienen en forma laxa la informacion para las proteinas del pancreas, lo cual junto a otros mecanismos contribuye enormemente a diferenciar las celulas, y como con la misma cadena de DNA todas expresan informacion distinta.

Fijate q complejo e interesante es entonces la compactacion, que es capaz de compactar selectivamente los genes q "no quiere usar".

Si me contas q me quisite decir con la segunda parte de la pregunta (lo de los piconewton), quisas te pueda contar algo mas.. o no

salu2

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supercuerda escribió el 01/12/2007 a las 04:03 hs. ¿Mensaje inapropiado?

#7 Re: Empaquetamiento del ADN

Eso queria saber o sea que se hace un Backup de lo que no se "necesita" y encima "comprimido" , tenemos en nuestro ADN un "Norton Backup" y un "compresor .ZIP", ALUCINANTE! ... la otra parte referente a la presion, me habia quedado flotando a raiz de una investigacion que realizaron en la Universidad de Berkeley donde hacen una comparacion y citan...

.... Durante los estudios, los investigadores pudieron medir que la fuerza del motor molecular podía llegar a los 57 – 60 picoNewtons, lo que a escala humana sería como levantar seis portaaviones, según han explicado....

Esa medida de presion, en que parte del proceso natural del ADN interviene para el empaquetamiento, se estan refiriendo precisamente a la compactacion...?

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