[Ayuda] Diseñando portales, como?

Hola gente:
Bueno mi duda o ignorancia me hace crear este tread.
La cosa es asi, como seria la teoria del diseño de un portal?
por ejemplo quiero crear un portal tipo nuke ( post o php ), en que me debo basar? que es lo que tengo tener en cuenta??
como se hacen los box o bloques?
se que es por medio de templates, pero no entiendo como se hace para poner en esos lugares los bloques.
ojala que me ayuden a sacar esta ignorancia.
thanks peoples