¿Existe una ditro de Linux que pueda ejecutar programas de Windows de manera nativa?

Hasta donde se no(usando algun soft como WIne podes correrlas),igualmente si pensas migrar a linux y solo usar soft diseñado para win es mejor que te quedes en este ultimo.

Si queres instalar una distro GNU Linux lo mejor es uqe uses aplicaciones nativas para este ultimo,para esto ultimo es recomendable que revises el siguiente tema: Programas Equivalentes Windows/Linux

slds

che buenisimo eso de los programas alternativos. Encontre esto tambien http://www.linuxalt.com/

para ejecutar programas de windows desde gnu/linux existen programas como wine o Vbox, no vienen de forma nativa, los tienes que instalar desde la lista de repositorios.
Existen algunas distros pensadas para ser usadas como liveCD/DVD/USB que traen wine de forma nativa un ejemplo es knoppix liveDVD 5.3.1 o knoppix liveDVD 6.1 CEBIT.
Claro que si tu quieres hacer una instalación en disco duro de un S.O. gnu/linux lo mejor es que empieces con ubuntu y luego le instales los programas tipo wine.

saludos...

nativa no pq no seria linux, para que sea nativa necesitas un kernel de win.

si queres algo que ejecute nativamente fijate con REACTOS, pero es alfa aun.

http://www.reactos.org/es/index.html

Con linux nunca va a ser nativa.