Vamos por orden... XP SP2 SI soporta ISA... Y lo sé muy bien, porque tengo andando una máquina con un K6-2 300 mhz y 96mbytes de RAM (de año 96)... Ahora, hay algunas consideraciones a tomar... Hay placas ISA muy antiguas que tenían jumpers para configurar el IRQ y el canal DMA. Estas placas SI se pueden instalar bajo WinXP, pero WinXP no las detecta automáticamente... Por lo que en ese caso hay que instalar el driver a mano.
Luego salieron las placas ISA PlugAndPlay que se autoconfiguraban solas (no tienen jumpers de ninguna clase): Esas placas WinXP las detecta y configura automáticamente, e instala los drivers necesarios para que funcionen. Suele ser el caso de todas las tarjetas de sonido onboard en mothers viejos.
En el caso de esa compu (el AMD k6-2 300), el audio onboard funcionaba, pero apenas accedía al disco, o a la tarjeta de video, era como si se frenara el audio ... Tal cual como describes tú.
Lo solucioné entrando al BIOS, en los seteos avanzados, dice "PCI latency timer", probá bajarlo al valor mínimo posible (suele ser 32). Eso solucionó el problema del audio, aunque frenaba el acceso al disco y al video...
Salu2, espero que te sirva