Aquí os pongo unos cuantos que tengo en favoritos, bien por haberlos usado para comprar billete, referidos por amigos o porque según buscaba me parecieron interesantes.
http://www.ryanair.com/ vuelos muy baratos si los pillas a tiempo, incluso gratis. Es la más usada por los estudiantes que se van de Erasmus a otro país.
http://www.buzzaway.com/english/index.cfm -> Realmente barata pero nos dejaron sin billete
http://www.flybe.com/obs/booking-controller/ -> No conozco a nadie que haya volado con ellos.
http://www.virgin-express.com/ -> Casi todos los vuelos pasan por Bruselas, pero es buena y barata (las pocas azafatas que lleva el avión ya merecen pagar el billete, las que me tocaron a mi al menos).
http://www.bmibaby.com/bmibaby/en-gb/index.aspx ->Barata, pero no he volado con ella ni conozco a nadie que lo haya hecho.
Buscadores de vuelos y subastas:
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http://www.muchoviaje.com -> Sólo las ofertas, el buscador sólo se fija en los vuelos regulares.
http://www.lastminute.com -> Sólo las ofertas
http://www.travelprice.com ->Sólo las ofertas
http://www.viajarbajoprecio.com/ -> Al principio no te aceptan ninguna oferta, luego es baratillo.
http://www.skyauction.com -> Sobre todo subastan viajes completos, pero también ofertan vuelos.
http://www.despegar.com http://www.retraso.com -> Te permite usar buscadores de otras páginas, publica ofertas....
http://www.atrapalo.com -> No está mal, pero hay que registrarse

aunque es gratuito
http://www.qixo.com/ http://www.cheapfares.com -> No busca ofertas pero a veces encuentra algo interesante
http://www.orbitz.com/ -> Bastante bueno para buscar viajes de vuelta de EEUU
http://www.priceline.com -> Buen buscador pero sólo para regreso de EEUU
Por supuesto
http://www.ebay.com